Что будет, если зарегистрироваться как самозанятый, но не вести деятельность?

Нет, способ оплаты не влияет на налогообложение.
☝️Главное для самозанятого — учитывать и отражать все полученные доходы в приложении «Мой налог», независимо от того, были они получены наличными или безналичным переводом.