Кто не может применять специальный налоговый режим «Налог на профессиональный доход»?

Нет, способ оплаты не влияет на налогообложение.
☝️Главное для самозанятого — учитывать и отражать все полученные доходы в приложении «Мой налог», независимо от того, были они получены наличными или безналичным переводом.